Gdy śmiertelny wirus Medousa rozprzestrzenia się na całym świecie, zamieniając ofiary w kamień bez nadziei na wyleczenie, ludzkość stoi na progu zagłady. Jedyną nadzieją jest szokująca propozycja korporacji Venus Gate: umieszczenie 160 osób w stanie kriogenicznym na okres do stu lat lub do czasu znalezienia lekarstwa. Kasumi Ishiki jest jedną z nielicznych wybranych do tego programu. Choć boi się rozstania ze swoją bliźniaczą siostrą, Shizuku, obie siostry trzymają się nadziei, że kiedyś się spotkają. Po obudzeniu Kasumi odkrywa świat zupełnie inny niż ten, którego się spodziewała. Instalacja kriogeniczna jest zarosła cierniami, a dziwne potwory atakują przebudzonych. Podczas gdy większość osób, które się obudzą, ginie w początkowym chaosie, Kasumi i garstka przetrwałych zaczyna eksplorować labiryntowy kompleks. Ich celem jest odkrycie tajemnic wirusa Medousa oraz prawdziwych motywów korporacji Venus Gate.