Alkohol, palenie i stres – w ciele poddanym działaniu tych drażniących czynników komórki odpowiedzialne za utrzymanie życia toczą wojnę, która nigdy się nie kończy. Ze względu na poważny niedobór pracowników, Sekkekkyuu AA2153 musi szybko nauczyć się dostarczać tlen i zbierać dwutlenek węgla, nawet w niebezpiecznych warunkach. Tymczasem Hakkekkyuu U-1196 musi wykonać swoją część pracy, walcząc z bakteriami i wirusami w sytuacjach zagrażających życiu. W trakcie tych kryzysów muszą współpracować, aby utrzymać ciało w zdrowiu, mimo że nie wiedzą, czy ich ofiary będą miały sens. Hataraku Saibou Black podejmuje temat w inny sposób, ukazując bardziej surową stronę zadań, które wykonują nasze komórki.