Rok 2072. Na Ziemi pojawiają się straszne potwory znane jako Aragami (Zamącone Bogi), które zaczynają polować na ludzi. W zaledwie kilku latach populacja ludzka zmniejszyła się do 1/100, a świat stoi na progu końca. Jednakże istnieje jedna grupa ludzi, która walczy z tymi feralnymi potworami, używając broni biologicznej znanej jako „Jinki” (Boski Urządzenie). Ci ludzie nazywani są „G.E.” (Bogojadami). Historia koncentruje się na jednym z Bogojadów, Silvie, i jego podboju, aby przywrócić nadzieję ludzkości...