W "Girly Air Force" nagle pojawiają się tajemnicze latające stworzenia znane jako Zai. Aby stawić im czoła, ludzkość opracowuje samoloty myśliwskie określane mianem "Córki" oraz zautomatyzowany system walki o nazwie "Anima", przyjmujące postać ludzkich dziewcząt. Fabuła koncentruje się na Kei Narutani, młodym mężczyźnie pragnącym latać, oraz Gripen, Annie uznawanej za atut ludzkości.