Jest to wiosna pierwszego roku liceum, a Kanji Sasahara znajduje się w dylemacie. Czy powinien zrealizować swoje dawne marzenie o dołączeniu do klubu otaku? Saki Kasukabe również stoi przed trudnym wyborem. Czy kiedykolwiek uda jej się przekształcić swojego chłopaka, fana anime Kousakę, w normalnego faceta? Kanji odnosi sukces tam, gdzie Saki ponosi porażkę, ponieważ zarówno Kanji, jak i Kousaka zapisują się do Genshiken: Towarzystwa Badań nad Współczesną Kulturą Wizualną. Nie poddając się, Saki podąża za Kousaką przez różne aktywności klubu, od cosplayu i konwentów komiksowych po gry wideo i kolekcjonowanie figurek anime – dowiadując się więcej, niż kiedykolwiek chciała, o humorystycznym świecie japońskiej fandomu...