W niedalekiej przyszłości niemal cały świat znajduje się w żelaznym uścisku potężnego koncernu, Persona Century Corporation. Pewnego dnia do Shinjuku, jednej z nielicznych stref niekontrolowanych przez Persona Century, przybywa tajemniczy, przystojny mężczyzna. Shinjuku to niebezpieczna i bezprawna strefa, pełna rebeliantów i terrorystów. Nowy przybysz znany jest jako Dark Side i przy pomocy małej grupy rebeliantów zamierza złamać uścisk Persony na świecie.