Rok 2055, cztery lata po wydarzeniach z Danball Senki W. LBX stały się największym hobby na świecie, na tyle znaczącym, że wspierają profesjonalne ligi i pozwalają ludziom zarabiać na życie jako zawodowi gracze LBX. Czternastoletni Arata jest nowym uczniem w Akademii Kamui Daimon Integrated, położonej na Wyspie Kamui niedaleko Japonii. Jako najbardziej prestiżowa instytucja na świecie szkoliąca graczy LBX i mechaników, przyjęcie do akademii wymaga pokonania niezwykle rywalizacyjnej bariery: wygrania co najmniej trzech oficjalnych turniejów. Wspólnie z innymi członkami swojego plutonu stawi czoła rywalom i odkryje sekrety ukryte wewnątrz akademii.