Chibi Maruko-chan to przydomek słodko irytującej 9-letniej dziewczynki. Oszukuje swojego dziadka, spędza godziny na rozmyślaniach, jak wydać kieszonkowe, i nienawidzi siedzieć obok brzydkich chłopców. Mówi, czuje i żyje tak, jak prawdziwe dzieci. Gdy rozpoczyna się drugi semestr, Maruko i jej klasa wracają do swoich małych grup. W grupie Maruko znajdują się dwaj psotni chłopcy, a Maruko zmuszona jest stać się jednym z ich podwładnych. Wygląda na to, że w szkole ma dużo presji. Gdy zbliża się szkolny konkurs sportowy, wszyscy uczniowie są zajęci ćwiczeniami. Maruko nie jest wyjątkiem, choć jej lenistwo sprawia, że czasem spóźnia się. Maruko zdaje sobie sprawę, że dwaj chłopcy rywalizują ze sobą we wszystkim, co robią, i że ich przyjaźń jest głęboka i silna.