Świat już się skończył. Przyszłość – w której toczyła się... i przegrano straszną walkę z pasożytniczym wirusem zwanym „Gastrea”. Ludzkość jest w ścisłym otoczeniu i żyje w rozpaczliwym nastroju. Rentarou i Enju codziennie stają przed niebezpieczeństwem w swojej pracy jako zespół specjalistów przeciwko Gastrea, znany jako „oficerowie bezpieczeństwa cywilnego”. Jakby codzienna walka z zagładą nie wystarczała, wkrótce staną przed zagrożeniem, które może zniszczyć cały Tokio...