Sieci rozciągają się na całym świecie, a ewolucja sieci informacyjnej osiągnęła swój szczyt. W tej erze istnieją dwa rozwinięte światy: „świat rzeczywisty” oraz „wired”, wirtualna sfera sieciowa. Toru Soma jest członkiem Steppen Wolf, grupy hakerskiej działającej swobodnie w świecie sieci. Ich ostatnia misja polega na ataku na bazę danych sił ONZ. Podczas tej operacji traci przyjaciela i lidera zespołu, Yuyę Nonomurę. Toru zostaje aresztowany przez wojsko. Aby uzyskać uwolnienie, jest zmuszony do pracy dla organizacji antyhakerskiej: Pierwszej Eskadry Biura Administracji Informacyjnej Sił Bezpieczeństwa ONZ. Podczas pracy dla nich poszukuje osoby, która zabiła jego przyjaciela, podczas gdy inni członkowie również mają własne powody do walki. Codzienne trzystronne konflikty toczą się między grupą terrorystyczną, przedsiębiorstwem bezpieczeństwa a armią. Różne wydarzenia zachodzące podczas tych walk wydają się na pierwszy rzut oka niezależne, ale zbiegają się w jednym wydarzeniu, jakby pociągane przez jakąś siłę. Na podstawie gry autorstwa GIGA.