Bakumatsu to era, w której dusze młodych mężczyzn płonęły z troski o przyszłość ich kraju. Takasugi Shinsaku, najemnik z Choshu, wraz ze swoim towarzyszem Katsura Kogorou nielegalnie wchodzi na rządowy statek, szukając tajemniczego „zegarka” mającego moc manipulowania czasem, który obawia się, że rząd chce zachować dla siebie. Zamiast pozwolić, by taka moc trafiła w złe ręce, Takasugi planuje zniszczyć artefakt, ale po jego zdobyciu zostaje on szybko skradziony, zmuszając dwójkę do podążania za tajemniczym złodziejem do siedziby rządu w Kioto. Jednak gdy docierają do stolicy, odkrywają, że rząd został obalony, a jego miejsce zajęło bóstwo Susanoo. Ulice miasta i jego mieszkańcy wyglądają zupełnie inaczej niż pamiętali to Takasugi i Katsura. Czasy się zmieniły, ale ich misja nie – Takasugi i Katsura postanawiają zresetować czas i uratować swój naród przed złymi siłami próbującymi go przejąć.