Yu☆Gi☆Oh! Arc-V koncentruje się na Yuuyi Sakaki, tajemniczym Rozrywkowym Dueleście znanym jako "Fantom", wraz z jego trzema innymi osobowościami: Yuuto, Yuugo i Yuuri. Był pościgiem Leo Corporation za włamanie się do ich Solid Vision z masowym systemem i używanie go do własnych celów. Podczas ucieczki spotyka Yuzu Hiiragi, córkę dyrektora Szkoły Duelewskiej Syu Zo, która była na skraju bankructwa. Oszukała Yuuyę, aby podpisał kontrakt na bycie nauczycielem w jej szkole. Jednak zanim Yuuya mógł nauczać w szkole, najpierw musiał znaleźć kartę o nazwie Genesis Omega Dragon, która rzekomo miała decydować o losie świata i była również powiązana z jego rozproszonymi wspomnieniami. Akcja rozgrywa się w alternatywnej wersji Miami City, gdzie Leo Corporation, kierowana przez prezydenta Reiji Akabę, dominuje w większości systemu Solid Vision w całym mieście. Rozprzestrzenianie się firmowego Solid Vision z masą nie tylko dało początek "Duelem Akcji", ale także pomogło poprawić stan miasta, ratując życie i naprawiając szkody w przypadku katastrof, stając się ważną częścią życia ludzi.