W roku 2283, w poatomowym pustkowiu, Twierdza Miasto 021 znajdowała się pod kontrolą korporacji Ark. Ich tak zwani "Strażnicy Zbawcy" rzekomo chronili ludzkość, ale w tajemnicy przeprowadzali eksperymenty na ludziach przy użyciu chipów X i manipulowali opinią publiczną. Młody Han Che stał się świadkiem morderstwa swojego brata przez tych fałszywych Strażników i nieoczekiwanie obudził w sobie "System Źródła 1307", zyskując nadludzkie moce. Dołączył do organizacji Yebushou, która została odbudowana przez Guan Shanhu, i walczył wraz z hakerem Tian Xinem i inżynierem Kang Di. Yebushou infiltrowało obozy szkoleniowe Arka i Więzienie na Wyspie Duchów, ujawniając spisek mający na celu stworzenie armii osób z nadludzkimi mocami poprzez eksperymenty i mutantów. Gdy Han Che odblokowywał nowe zdolności i stawał twarzą w twarz z potężnymi wrogami, takimi jak Cesarz Anioł i Śmiertelnik z Boskim Okiem, podjął drogę zemsty, prawdy i zbawienia. Jednak ukryty sztuczny inteligent "Lefu" spiskował, by przejąć kontrolę nad całą świadomością ludzką.