Pół roku temu na niebie pojawiła się gigantyczna pajęczyna. Przez pewien czas przyciągała uwagę mediów. Gdy jednak nic się nie działo, ludzie wrócili do normalnego życia, ignorując pajęczynę. Amedome Tsutsuji żyje swoim codziennym życiem pod jej osłoną. W szkole nadano mu przydomek „Ninja”, ponieważ jest tak łatwy do przeoczenia. Nawet drzwi automatyczne nie reagują na jego obecność, nie otwierając się. Jednak on widzi to, czego inni nie widzą: z pajęczyny zstępują przybysze z kosmosu, przejmując ludzkie ciała jako gospodarzy i zjadając ludzi. Z tego powodu wykorzystuje swoje ninja-owskie umiejętności, aby pilnie strzec swojej wybranki, Mizuno, gdy wraca ze szkoły. Innymi słowy, ją tropi, ale z najlepszymi intencjami. Jest zdeterminowany, by być przy niej i chronić ją, gdy atakują pajęczaki z kosmosu. W tym celu łączy siły z innym, bardziej przyjaznym przybyszem o imieniu Tsuda, który daje mu potężną broń: kran. Czy Tsutsuji będzie w stanie chronić Mizuno przed pasożytniczymi pajęczakami z kosmosu za pomocą swojego wiernego kranu?