Po dwóch latach uśpienia w ciele Tsutomu Senkawy, Birdy zostaje gwałtownie obudzony przez przypadkowe spotkanie ze swoim dawnym wrogiem. Gdy Birdy ponownie zaczyna rozprawiać się ze złem, stopniowo odsłaniają się mroczne tajemnice związane z eksperymentami przeprowadzanymi przez korporację „Agni”. Wygląda na to, że eksperymentują oni z wzmocnieniem ludzkiego ciała, tworząc to, co nazywają „ludźmi-bestiami”, aby walczyć z inwazjami obcych powiązanymi z Birdy.