Tensai Bakabon opowiada historię dziecięcego geniusza i jego „filozoficznego” ojca. Ojciec Bakabona trzyma się własnej filozofii, nie szczędząc żadnych wysiłków w poszukiwaniu odpowiedzi. Mimo że ma zdolność do robienia kłopotów, Papa Bakabon jest w jakiś sposób uznawany za „Wielkiego Filozofa” i wzywany do udzielenia porady, co nieuchronnie prowadzi do katastrofalnych skutków. Tensai Bakabon towarzyszy ojcu w tych filozoficznych poszukiwaniach, doprowadzając mieszkańców miasta do szaleństwa.