Jim Hawkins to młody chłopiec, którego rozgrywające się wydarzenia pędzą na poszukiwanie legendarnego skarbu niegdyś strzeżonego pirata, kapitana Flinta. W drodze na Wyspę Skarbów John Silver, najlepszy przyjaciel Jima, przejmuje dowodzenie nad statkiem, ujawniając swoją prawdziwą twarz jako bezwzględny pirat, który niegdyś był prawą ręką Flinta. Czuąc się zdradzony, Jim musi zmierzyć się ze swoimi sprzecznymi uczuciami i konfrontować się ze Silverem, który nadal uważa siebie i Jima za przyjaciół.