Zadani celem pomocy ludziom na swoim kampusie, „Sket-dan” to klub złożony z trzech różnych jednostek: Yuusuke Fujisaki, nieco krótkowzrocznego, ale pełnego energii chłopaka w czerwonej czapce i okularach ochronnych; Hime Onizuka, dziewczyny o męskich manierach, znanej ze swojej niezwykłej siły i ekstrawaganckiego makijażu; oraz Kazuyoshi Usui, najinteligentniejszego członka, który mówi wyłącznie za pomocą syntezatora mowy. Mimo ich samopochwalebnych umiejętności, klub rzadko otrzymuje jakieś zadania, co sprawiło, że członkowie stali się raczej pesymistyczni i zdemotywani. Jednego dnia, ku zdumieniu trójki, do Sket-dan przychodzi uczeń liceum o imieniu Ichiro Yamanaka z prośbą. Ichiro wyjaśnia, że jego dziewczyna, Nanako Watanabe, nagle zerwała z nim bez żadnego widocznego powodu, a on chce zrozumieć, dlaczego zachowuje się tak dziwnie. Zachwyceni tym, że w końcu otrzymali prawdziwe zlecenie, trójka postanawia pomóc Ichiro w jego trudnej sytuacji. Jednakże, gdy kontynuują swoje śledztwo, grupa zdaje sobie sprawę, że sytuacja może być bardziej skomplikowana, niż początkowo myśleli.