Tokio, 2029. Uważano, że dinozaury wymarły po uderzeniu asteroidy, lecz w tajemnicy przetrwały, przenosząc swoje DNA na ludzi poprzez krzyżówki. Ukryci wśród zwykłych obywateli, polują teraz na ludzi, pozostając niewykryci w społeczeństwie. Przeciwstawia im się tajny zakon ninja, który wykorzystuje Ryugesho – unikalny pigment nasycony starożytnymi wspomnieniami. Nakładając tę tajemniczą substancję, uwolnią w sobie dinozauryczne moce i walczą z drapieżnikami zagrażającymi ludzkości. Gdy dinozaury rozpoczynają kampanię mającą na celu wykończenie ludzkości, ninja mobilizują się, by ich powstrzymać. Rozpoczyna się walka o przetrwanie obu gatunków.