Po zakończeniu swojej podróży po regionie Hoenn, Satoshi udaje się do regionu Sinnoh, by kontynuować swoją przygodę na drodze do tytułu Mistrza Pokémonów. Tuż po przybyciu, Team Rocket ponownie próbuje skradnąć Pikachu, ale znów nie powodzi im się. Jednakże Pikachu wpadł głęboko w las, a Satoshi musi go odnaleźć! W trakcie poszukiwań ponownie spotyka Takeshiego – hodowcę Pokémonów, z którym podróżował przez wiele regionów – oraz poznaje swojego przyszłego rywala, Shinjiego, ambicyjnego trenera, któremu mało zależy na uczuciach swoich Pokémonów. Wciąż szukając Pikachu, Satoshi dostrzega w oddali potężny atak elektryczny i kieruje się w jego stronę, gdzie znajduje Pikachu wraz z Team Rocket i Hikari – początkującą trenerką dążącą do tytułu najlepszej koordynatorki Pokémonów. Po pokonaniu planów Team Rocket, Satoshi ponownie łączy się z Pikachu, a Hikari dołącza do grupy. W ten sposób Satoshi i jego przyjaciele rozpoczynają swoją podróż przez fascynujący region Sinnoh.