W tej kontynuacji wydarzenia rozgrywają się cztery lata po zakończeniu pierwszego sezonu. Papuwa-kun to tajemniczy chłopiec mieszkający na nowej tropikalnej wyspie zaludnionej przez te same dziwaczne stworzenia. Razem ze swoją pokojówką, Liquid, oraz nowym przyjacielem cierpiącym na amnezję, „Rotarou”, wyruszają w nonsensowne przygody, próbując jednocześnie omijać i mylić ślady Armii Ganma, Korpusu Specjalnego oraz nawet Shinsengumi, którzy pragną odkryć prawdziwą tajemnicę Rotarou i go porwać.