W XXI wieku na Ziemi przybyli obcy, którzy mieszkają wśród ludzi. W spokojnym Enohana biedna studentka Mayuko Chigasaki zaczyna żyć wspólnie z NieA, obcą z niższej kasty („Under Seven”). Podczas gdy Mayuko pilnie stara się utrzymać się z życia, NieA wydaje się całkowicie obojętna na konsekwencje swoich działań. Gdy ten dziwny duet wywołuje oczekiwane iskry, w tle góruje zniszczony statek kosmiczny obcych...