Medabots to potężne roboty wyposażone w sztuczną inteligencję za pomocą specjalnych "medali" i służą woli swoich właścicieli. Najczęściej są wykorzystywane w "Robbatlingu", popularnym sporcie walki, w którym dwa medaboty walczą ze sobą. W profesjonalnych rozgrywkach Medafighters wykorzystują swoje Medabots, aby zakwalifikować się do Turnieju Światowego, rywalizując z elitą o tytuł mistrzowski. Uczeń szkoły podstawowej Ikki Tenryou właśnie nabył swojego pierwszego Medabota: Metabee'a, przestarzały model pozbawiony medalu. Na szczęście Ikki znajduje medal w pobliskiej rzece; jednak po włożeniu go do głowy Metabee'a, robot zaczyna wykazywać dziwne zachowanie. Krótko palący się i buntowniczy, Metabee odmawia wykonywania poleceń Ikkiego. Mimo to, aby awansować w rankingu w kierunku Turnieju Światowego, Ikki i Metabee muszą nauczyć się współpracować, niezależnie od tego, jak trudne to zadanie może się wydawać…