Mirai to 13-letnia dziewczyna mieszkająca w świecie ludzi. Pewnego dnia jest świadkiem upadku tajemniczego obiektu z nieba do parku. Podekscytowana, zabiera ze sobą swojego pluszowego misia, Mofuruna, aby zbadać sytuację. Po dotarciu na miejsce widzi dziewczynę o imieniu Riko, która leci na miotle. Riko ma ten sam wiek i pochodzi ze świata magii. Mirai ma wiele pytań, a Riko wyjaśnia, że szuka potężnego klejnotu zwanego „Link Stone Emerald”. Następnie pojawia się Batti, sojusznik użytkowników ciemnej magii, Dokurokushi, i żąda, aby Riko przekazała mu „Link Stone Emerald”, którego sama szukała. Aby sprawić, by sytuacja była jeszcze gorsza, Batti używa ciemnej magii, aby stworzyć potwora znanego jako Yokubaru! Mirai i Riko łączą siły i, używając magicznych słów „Cure-up Rapapa!”, zmieniają się w legendarnych Pretty Cure.