Kotatsu Neko jest oparty na japońskim filmie z 2006 roku w gatunku „live-action science-fiction/fantasy romance” o tym samym tytule. Akcja rozgrywa się w konkretnej dzielnicy Tokio, gdzie pod kotatsu mieszkają dwa koty. Shito to biały kot o dziewczęcej powierzchowności, podczas gdy Zero to chłodny czarny kot. Ich właściciel, Rei „Junior” Fujisaki, to trzecie rocznik szkoły średniej, hikikomori, obsesyjnie zainteresowany grami. Ma uczucia do dziewczyny z jego klasy, ale, naturalnie, brakuje mu odwagi, by się do niej przyznać. Shito również hoduje w sekrecie jednostronną miłość.