"Parazyty" to stworzenia wielkości piłeczki tenisowej, pochodzenia i liczby nieznanej. Inwazją na ludzkie umysły zapewniają sobie przetrwanie. Shinichi Izumi to 16-letni uczeń liceum, mieszkający z rodzicami w spokojnej dzielnicy. Pewnej nocy Parazyt inwazją na ciało Shinichiego próbuje przejąć nad nim kontrolę. Jednakże nie udaje mu się dokończyć przejęcia i kończy na zamieszkaniu tylko jego prawej ręki. W rezultacie zarówno Shinichi, jak i Parazyt – który nazywa się Migi – zachowują swoje indywidualne umysły. Teraz, w specyficznej relacji "człowieka i obcego", Migi proponuje współpracę w celu przetrwania. Shinichi nie ma wyboru i musi się zgodzić, a on i Migi muszą stawić czoła innym krwiożerczym Parazytom, trzymając się przy tym swojej moralności.