Akcja rozgrywa się w czerwcu 1863 roku i koncentruje się na mężczyźnie z amnezją, który przybywa do siedziby Mibu Roushigumi w Kioto. Zastępca dowódcy, Souji Okita, przyjmuje go pod swój dach, nadając mu imię Jinsuke Tachikawa, po czym zaczyna on życie jako członek grupy. W miarę jak Mibu Roushigumi – później znane jako Shinsengumi – zyskują znaczenie podczas chaosu końcowego okresu Edo, Jinsuke i jego współtowarzysze zostają wciągnięci w burzliwe wydarzenia tamtej epoki. Gdy Jinsuke w pełni odzyskuje wspomnienia, świat wokół niego ulega nieodwracalnym zmianom.