W magicznym królestwie znanym jako Jewel Land, magowie zamieniają Jewelpets w klejnoty, aby umożliwić im podróż do magicznego lasu, z wyjątkiem Rubiego, białego królika, który lubi się bawić. Jednak silny wiatr zbija bocian z kursu, rozlewając klejnoty i rozrzucając je po mieście Takaragaseki na Ziemi. Ruby, która musi stawić czoła karze, zostaje wysłana na Ziemię, aby odnaleźć swoich przyjaciół. Na Ziemi uczennica o imieniu Rinko obserwuje nocne niebo z balkonu i widzi grupę spadających gwiazd; jedna z nich wpada do jej szklanki z wodą i zamienia się w czerwony klejnot. Następnego dnia ona i jej przyjaciółka Minami zostają uratowane przez mężczyznę o imieniu Keigo Taitō przed rabunkiem w sklepie jubilerskim. Wyjaśnia im, że pracuje dla specjalnej organizacji powiązanej z magami z Jewel Land i opowiada im o Jewelpets. Po tym, jak Rinko obudzi Ruby, a później spotka Alicję, ich zadaniem staje się zebranie wszystkich Jewelpets, aby zwrócić je do Jewel Land, zanim złowrogie Jewelpet o imieniu Diana nie dostanie ich pierwszej. W miarę postępu serii, główne bohaterki odkrywają nowych Jewelpets w drodze. Tymczasem Dian, kolejne Jewelpet zdolne do używania Czarnej Magii, budzi się ze stanu klejnotu. Bohaterowie muszą teraz stawić mu czoła oraz spustoszeniu i chaosowi, które spowoduje zarówno w Jewel Land, jak i w Świecie Ludzkim.