W roku 2010 n.e. na całym świecie jednocześnie wybuchły hiperhuragany, zadając poważne szkody. Zginęło pięć miliardów ludzi, co zmniejszyło populację globu do trzech miliardów. Istniejące gospodarki i wojska zostały zniszczone. Kraje zostały zamrożone w twardej lodzie, równiny zatopione pod oceanami, a świat uległ drastycznej transformacji. Cywilizacja ludzka wpadła w erę chaosu. Bieda rozkwitała poza strefami gospodarczymi, a getta stały się powszechne. Warstwa rządząca, nazywająca się Logos, utrzymywała swój status za pomocą siły militarnej. Nazwali biednych Revenusami, wygnawszy ich do życia poza specjalnymi strefami gospodarczymi. Od tamtej pory minęło trochę czasu. Katsuragi Jo i Tsurasawa Jin uciekają przed Phantom, organizacją odpowiedzialną za monitorowanie Revenusów i tłumienie buntowniczych frakcji wewnątrz Logos, zabierając ze sobą tajemniczą dziewczynę o imieniu Nobuto Sana. Wielu stron jest zainteresowanych nią, każda napędzana własnymi motywami.