1945, Japonia. Gen Nakaoka to pełen energii sześciolatek, który mieszka ze swoją biedną, ale kochającą rodziną w czasie wojny w Hiroszimie. W miarę trwania II wojny światowej ojciec Gena, Daikichi, należy do nielicznych, którzy otwarcie sprzeciwiają się cesarzowi i wspierają niewinnych cywilów, którzy ponoszą największe ciężary wojny. Jednak w społeczeństwie zdefiniowanym przez gorączkowe poparcie dla narodu, Gen i jego rodzina są wykluczeni jako zdrajcy. Nie wiedzą, że ludność Hiroszimy czeka straszny los... Jednego spokojnego ranka siły amerykańskie zrzucają bombę atomową na Hiroszimę. W mgnieniu oka miasto zostaje całkowicie zniszczone, pozostawiając tysiące martwych i wielu więcej narażonych na promieniowanie. Choć Genowi udaje się przetrwać wybuch, jego życie zostaje nieodwracalnie zmienione. Po ponownym zebraniu się z tym, co zostało z jego rodziny, Gen musi teraz zmierzyć się z głodem, nędzą i niesympatycznym społeczeństwem, które postrzega przetrwałych jako nic więcej niż chorych żebraków. Oparty na rzeczywistych doświadczeniach autora Keiji Nakazawy, Hadashi no Gen śledzi Gena i jego współprzetrwałych w ich walce o przetrwanie w Hiroszimie po wojnie. Gen postanawia iść dalej z niezłomną determinacją, nigdy nie przebaczając tym, którzy spowodowali tę zbrodnię, nigdy nie zapominając bólu bomby i nigdy nie pozwalając, by jego duch został złamany przez tragedię.