Pokonanie Eonii zapoczątkowało erę pokoju, otwierając drogę do odkrycia Bramy do NEUE, dotąd nieznanej galaktyki. Ponieważ nie ma już międzygalaktycznych zagrożeń do stłumienia, oryginalny Zespół Aniołów się rozpadł, a byli Aniołowie pomagają w budowaniu sojuszu z ich nowymi sąsiadami. Jak na złość, Bramą może sterować tylko Milfeulle, która musi pozostać uwięziona, dopóki nie zostanie znaleziona jej zastępca.admirał Takuto Meyers zmobilizował nowo utworzony Zespół Rune Angel, aby uratować swoją narzeczoną, ale czy ci nowicjusze są w stanie sprostać wyzwaniu?