Tajemnicze zlecienie prowadzi Wendy Marvell i jej kociego towarzysza Charlesa do wioski Nanalu, gdzie odkrywają, że osoba, która zleciła zadanie, w rzeczywistości nie istnieje. Zamiast tego Wendy zaprzyjaźnia się z Yoshino: dziewczyną w swoim wieku i jedyną magiem we wsi. Wendy szybko dowiaduje się, że mieszkańcy wioski stopniowo znikają, rzekomo z powodu klątwy nałożonej przez martwego smoka. Zmuszona do działania sama, wraz z Charlesem, Wendy jest zdeterminowana, aby pomóc Yoshino uratować wieś. Fairy Tail: Blue Mistral przedstawia przygody Wendy i Charlesa krótko po dołączeniu do gildii Fairy Tail. Wendy mierzy się z duchem smoka, przeklętym pałacem i innymi trudnymi wyzwaniami, desperacko chcąc udowodnić swoją wartość jako członkini Fairy Tail.