Po uderzeniu meteorytu w Ziemię siły zdrajców skutecznie przejęły kontrolę, pozostawiając ludność na pastwę cierpień. Wśród chaosu Tetsuro Daiba, chłopiec, który stracił rodziców w wyniku uderzenia, zostaje odwiedzony przez Mello, tajemniczą kobietę, która pojawia się w jasnym świetle. Gdy Daiba odzyskuje przytomność, znajduje się pod obserwacją w infirmerii statku kosmicznego. Ukrada myśliwiec, którego nie umiał pilotować (dopóki nie spróbował), i ucieka, latając z wprawą prawdziwego profesjonalisty. Był w stanie przywołać techniki pilotowania z pamięci zapisanej w DNA... a aby dowiedzieć się więcej, jego przyjaciel lekarz zabiera go do tajnego podziemnego laboratorium, gdzie działa jako profesor badający sposoby na powstrzymanie reżimu zdrajców. Gdy siły wdzierają się, aby go odzyskać, dziewczyna o imieniu Rei Yuuki tajemniczo zestrzeliwa ich cały lotniskowiec, używając tylko myśliwca! Wyraźnie obaj posiadają tajemnicze moce, których pragną wrogowie, co może lub nie może być powiązane z ich statusem jako jedyne dwie znane osoby przetrwałe uderzenie meteorytu. Podczas poszukiwań trzeciego przetrwałego (który okazuje się być kotem), obaj są przymusowo zabrani do Królowej Photon (władczyni reżimu zdrajców), która twierdzi, że ma zamiar RATOWAĆ Ziemię przed tymi, którzy wysłali Meteoryt. Obaj nie są pewni, czy mają jej ufać, czy Mello, dopóki (telepatyczny) kot nie wyprowadzi ich z zamkniętej komnaty Królowej, a Mello nie przybywa, aby wyjaśnić sytuację. Wtedy oni dwaj (ehm, trzej) podejmują decyzję... Zostać na planecie, która nie może wspierać ich zaawansowanej rasy, czy wyruszyć w nieznane przestrzeni kosmicznej?