Wiosną 1998 roku 15-letni Kouichi Sakakibara właśnie przeprowadził się do miasta Yomiyama, gdzie ma rozpocząć naukę w Szkołe Średniej Yomiyama North. Jednak stary uraz nawraca, co skutkuje jego hospitalizacją i sprawia, że przegapia pierwszy tydzień zajęć. Choć szybko się powraca, przed wypisaniem spotyka Mei Misaki – dziwną dziewczynę z okulem, której krypticzna postawa budzi w nim subtelne zainteresowanie. W szkole Yomiyama North Kouichi zostaje przydzielony do klasy 3-3. Jednak pod pozornie niewinną atmosferą dostrzega dziwne zachowanie klasy: wszyscy wydają się napięci i uważnie obserwują jego ruchy. Co więcej, choć Mei jest uczennicą tej klasy, ani koledzy, ani nauczyciele nie zwracają na nią uwagi, zachowując się, jakby nie istniała. Gdy pojawiają się kolejne dziwne zjawiska, a pytania mnożą się, nikt nie chce udzielić Kouichimu odpowiedzi. Nie mając wielu opcji, by zaspokoić rosnącą ciekawość, Kouichi zaczyna szukać pomocy u Mei, ignorując ostrzeżenia zarówno klasy, jak i samej dziewczyny.