Fabuła rozpoczyna się sceną zdominowaną przez żal, chaos i rozpacz. Sora mieszka ze swoją młodszą siostrą, Ann, oraz swoim dość komicznym ojcem. Ann jest solistką szkolnego chóru, podczas gdy Sora jest wybitnym kucharzem. Przygotowuje dla siostry „poważny” (honki) bento na jej szkolny koncert. Gdy Ann zaczyna śpiewać solo, tajemnicza siła tworzy pęknięcie w rzeczywistości, powodując, że istnienie Anny rozpada się na oczach wszystkich. Sora bieży, by ją uratować, ale on sam staje się częścią tego mrocznego rytuału. Sora trafia do świata fantasy pełnego gigantycznych grzybów, gdzie nic nie jest pewne co do tego, co stanie się z tymi dwojgiem.