Bezskrupuły minister Honest wykorzystuje ignorancję młodego, nowego cesarza, sprytnie rządzając krajem z cienia, kierując się zniekształconą moralnością i nie dbając o ludzkie życie. W rezultacie epidemia przestępczości i korupcji rozprzestrzeniła się po całym mieście stolicy, prowadząc do społeczeństwa, w którym przywilejowi posiadają absolutną dominację nad niższymi. Jednakże istnieje organizacja walcząca z tym rozpowszechnionym nadużywaniem władzy: Night Raid, tajny oddział opozycyjnej Armii Rewolucyjnej. Składa się z małej grupy bezwzględnych zabójców, którzy mordują wszystkich tych, którzy uczestniczą w haniebnych czynach Imperium lub zamykają na nie oczy. Tatsumi to naiwny, młody mężczyzna z mieczem, który wyrusza w podróż, aby uratować swoje zubożałe wieś. Wkrótce na własne oczy staje się świadkiem krwawych okropności i okrucieństw stolicy. Przeciążony nienawiścią, Tatsumi zostaje zachwycony głęboką sprawą Night Raid i decyduje się do nich dołączyć, rozpoczynając bolesną i niebezpieczną misję zemsty na ministrze Honest. Tatsumi zdobywa wiele cennych doświadczeń, odkrywając etykę konfliktujących ideologii, życie i śmierć, jednocześnie dążąc do przywrócenia humanitarnego świata.